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有些人认为笼养系统中异常蛋更多，这是一个误解。在笼养系统中，可以收集所有的鸡蛋，但在地面平养系统中，仅收集产在产蛋箱和垫料上的鸡蛋。地面平养系统中的一些异常鸡蛋和薄壳蛋不产在产蛋箱中，因此它们不被注意，没有算入异常鸡蛋中。
卵黄自卵巢排卵24～26小时后，母鸡到产蛋箱中产蛋；如果排卵后4个小时就产蛋，产下的鸡蛋为薄壳蛋，且母鸡不到产蛋箱中产蛋；如果母鸡的输卵管中没有鸡蛋，母鸡也会按时卧在产蛋箱里；如果母鸡排卵长达28小时后才产蛋（产蛋延迟4～6小时），蛋壳上就会有多余的钙斑，尽管没有产蛋，母鸡还会按时卧在产蛋箱中，之后，母鸡就在它所在的地方产蛋，因为当时母鸡不需要找产蛋箱。因此，一般只会在笼养系统或垫料中发现这些异常鸡蛋。对于褐壳蛋鸡，很容易通过在鸡蛋一侧的白色环状钙斑而识别这些产蛋延迟的鸡蛋，而对于白壳鸡蛋，因为很难看清白色钙斑，所以很难注意到这些鸡蛋。
一、常见的异常蛋
1.薄壳蛋、软壳蛋。任何情况下的薄壳蛋、软壳蛋都是比较难发现的，地面平养系统中，在鸡栖息的棚架下面的鸡粪中可能有薄壳蛋、软壳蛋。笼养系统中，因有其他鸡的阻挡，薄壳蛋、软壳蛋不能顺利的滚落，经常卡在鸡笼的底部。因此，要仔细检查鸡笼的下面或者棚架下面的鸡粪。
薄壳蛋、软壳蛋缺少了大部分蛋壳。可能的原因是：如果母鸡开始产蛋较早，在产蛋早期，快速连续的排卵，使蛋壳形成之前就产蛋。输卵管分泌的钙质赶不上快速连续的卵黄形成。薄壳蛋和软壳蛋也可能由高温或疾病（如产蛋下降综合征）等因素引起。
2.砂壳蛋。有多种原因引起，如传染性支气管炎，也可能与鸡的品种有关。局部粗糙，经常在鸡蛋的钝端，可能由传染性支气管炎病毒感染引起，这种情况下鸡蛋的内容物水样，症状取决于鸡的种类，但是蛋壳将会增厚，鸡蛋的内部质量没有问题。鸡蛋的尖端比较粗糙且蛋壳较薄，与鸡蛋的健康部分有明显的分界（鸡蛋的尖端光亮），原因是繁殖器官感染特殊的滑液囊支原体毒株。
3.脆壳蛋。产蛋后期，蛋重较大，该种鸡蛋的蛋壳脆弱。此时要及时调整饲料中的钙含量，额外添加钙。因为蛋壳主要在晚上沉积，要确保在天黑之前喂好母鸡。脆壳蛋也可能是母鸡的饲料摄入量出现问题（疾病或高温）而引起。
4.环状钙斑蛋。有环状钙斑的鸡蛋比正常产蛋时间晚、6～8个小时，可在地面或棚架上的任何地方发现这样的鸡蛋，因为母鸡产蛋时正好呆在那里。
有时会意外的在褐壳蛋鸡下的蛋中遇到白壳蛋。这可能是因饲料中残留的抗球虫药（尼卡巴嗪）引起，即使微量的抗球虫药也可以导致白壳蛋，抗球虫药可以杀死受精鸡蛋中的胚胎。白壳蛋的另外原因是感染传染性支气管炎、火鸡鼻气管炎和新城疫。
5.脊状壳蛋。鸡蛋出现脊状蛋壳，可能的原因是蛋鸡遭受应激。
6.畸形蛋（细长鸡蛋）。是因输卵管中同时有2个鸡蛋在一起，这与疾病有关，主要由母鸡的遗传特性引起。
二、引起蛋壳异常的常见因素
1.产蛋之前的因素引起的蛋壳异常。鲜蛋的外部质量指标有蛋重、颜色、形状、蛋壳的强度和洁净度等。鸡蛋的裂缝和破碎经常与笼底或者集蛋传送带出现的问题有关，有缺陷或脏的蛋壳与母鸡的健康状况、饲料的成分和产蛋箱的污物或者笼底的鸡粪有关。鸡蛋的形状各不相同，这是由母鸡的遗传特性决定的，与疾病或者饲养管理无关。在蛋壳形成过程中，母鸡沉郁也会导致蛋壳破裂。
2.产蛋之后引起的蛋壳异常的因素。血斑蛋蛋壳上的血迹来源于损伤的泄殖腔，因鸡蛋太重或者啄肛导致泄殖腔损伤。
灰尘环是由鸡蛋在肮脏的地面滚动时造成的，在鸡笼和产蛋箱中的灰尘也可引起灰尘环。另外，应确保鸡蛋滚到集蛋带上时的蛋壳干燥，也可以用一个鸡蛋保护器保持鸡蛋干燥，并使鸡蛋缓慢滚落到鸡蛋带上，这样灰尘就不会沾到蛋壳上。当然，鸡蛋不能在鸡舍中放置太久，应定期清理鸡蛋带。
产蛋时，鸡蛋温度是38℃，且无气室；产蛋后，鸡蛋的温度骤降到20℃左右，鸡蛋的内容物收缩，空气通过蛋壳的气孔被吸收到鸡蛋内，就形成了气室。但是，刚产后蛋壳很脆弱，少量的蛋壳会被吸到鸡蛋里
鸡蛋上的鸡粪可能是肠道疾病导致母鸡排稀薄鸡粪的结果；湿的鸡粪也可能是由于不正确的饲料配方引起；如果使用可滚动的产蛋箱，需要检查产蛋箱驱动系统，如果该系统不能正常工作或关闭太迟，鸡蛋被脏的产蛋箱底板污染。如果使用人工鸡蛋的产蛋箱，一定要保重产蛋箱清洁干净。
三、蛋壳的裂缝和破裂
产蛋后不久，鸡蛋即可能被损坏，鸡蛋上出现破裂、发丝裂缝、凹陷或小洞。
应观察损坏的位置和性质。在鸡蛋的尖端或钝端的小洞说明产蛋时鸡蛋大力撞击了底板，这也说明鸡笼中钢丝板已陈旧或太坚硬，或者产蛋箱中有凸起；鸡蛋的一侧有裂缝和破裂，说明当鸡蛋从鸡笼或产蛋箱滚落到鸡蛋带的过程中，或者在运输过程中，鸡蛋被损坏。
应仔细检查鸡蛋的生产过程：从母鸡到集蛋台，鸡蛋是轻轻的滚动吗？它们之间会相互滚动撞击吗？鸡蛋带之间的过渡是一条直线吗？鸡蛋带上的鸡蛋越多，鸡蛋越容易产生裂缝和破裂。因此，要确保经常经常收集鸡蛋，至少1天2次。每个系统都有需要注意和仔细检查的地方。例如，在地面平养系统中，如果95%的鸡蛋都在鸡蛋带的同一个地方，被破坏的几率将增大。这是由母鸡喜欢在相对固定的产蛋箱产蛋而导致的结果。应对措施是，让鸡蛋带多运行几次，使鸡蛋的分布均匀。
在笼养系统中，受惊吓的母鸡突然飞起来，或者四处乱蹦，也可能会导致鸡蛋的裂缝和破裂。如果这种情况发生，找到惊吓母鸡的原因，例如，鸡舍中有野鸟，还是金属部件上有电流？
太多的鸡蛋堆积在一起，鸡蛋的一侧将会被压损坏。鸡蛋的裂缝和破裂也可能是由鸡蛋带运行的速度太快且不停地打开和关闭，使鸡蛋相互碰撞而引起。鸡蛋带最好要缓慢运行，而非快速运行和频繁开关。有时，鸡蛋的裂缝和破裂也经常发生在产蛋末期。在产蛋末期，可能由于饲料中缺乏钙，鸡蛋的蛋壳变得比较脆弱。
错误地放置鸡蛋（横放在鸡蛋托盘上）将会造成托盘中的鸡蛋破裂，这不仅仅是鸡蛋的损失，打碎的鸡蛋也可能会污染托盘中的其他鸡蛋，产生臭鸡蛋的味道。
放置鸡蛋时，要尖端向下，气室向上。气室部位是最脆弱的，在运输过程中避免气室承载整个鸡蛋的重量，另外，鸡蛋尖端向下放置时，蛋黄的位置处在鸡蛋的正中间。
一侧有裂缝和破裂的鸡蛋，当鸡蛋滚动时，蛋壳容易被破坏。鸡蛋钝端有裂缝和破裂，说明产蛋箱底板太硬，产蛋时鸡蛋落到产蛋箱底板而被破坏。
在蛋鸡养殖中，如果在生产的最后阶段中鸡蛋被磕坏，则完全是投资的浪费。因此，对纸托盘或者塑料托盘的少量投资是值得的。尽管塑料托盘的投资成本高，但是有持久耐用的优点。用蛋筐运送鸡蛋会产生很多不必要的磕裂和损坏（破损率高达20%），用托盘运输鸡蛋的破损率仅为2%。因塑料托盘容易清洁，所以，比重新利用纸托盘更卫生。另外，大部分鸡蛋加工过程都是自动的，纸托盘不适于这一加工过程。因此，塑料托盘越来越流行。
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