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灭活疫苗抗原是完整的病毒颗粒，具有充分的B细胞位点和T细胞位点。流行口蹄疫病毒毒株微小的变异对疫苗效果不会产生颠覆性的影响。由于灭活疫苗采用双相佐剂，产生免疫应答也较快。其缺点在于过敏反应难以完全克服。
合成肽疫苗只有单一抗原位点的多肽（仅有41个氨基酸），对特定毒株具有较强的免疫力，但流行毒株微小的变异对其影响较大。由于采用单相油佐剂，免疫应答较慢。由于合成肽不存在异体蛋白，几乎不产生过敏反应。
综合两者的特点，采用两者交互免疫可以取长补断。由于两者之间抗原共性比例较大，交互免疫可以起到相互加强的作用。由于两者间仍存在差异，利于抗原的相互补充，同时减少了各自的抗体对另一方疫苗抗原的封闭而造成的干扰现象。
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类 型 |
合成肽疫苗 |
灭活疫苗（进口佐剂） |
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免疫类型 |
体液免疫、细胞免疫 |
体液免疫、细胞免疫 |
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剂 型 |
油包水型（W/O） |
水包油包水型（W/O/W） |
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免疫机制 |
同灭活疫苗 |
灭活疫苗 |
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免疫持续期 |
抗体水平维持至少6个月 |
抗体水平维持2～6个月 |
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不良反应 |
无不良反应 |
发热、过敏反应、流产甚至死亡 |
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生物安全隐患 |
无 |
存在灭活不完全隐患 |
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免疫剂量 |
1ml |
2~3ml |
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灭活剂 |
不使用 |
二乙烯亚胺（BEI） |
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稳定性 |
保存期内免疫效力不降低 |
保存期内免疫效力可能降低 |
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佐 剂 |
法国SEPPIC Montanide ISA 50V |
法国SEPPIC Montanide ISA 206 |
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抗原成份 |
纯净的特异性多肽 |
灭活的病毒146S粒子 |
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抗原含量 |
25μg/头份 |
1.5μg/头份左右 |
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疫苗纯净度 |
纯净 |
含细胞碎片、变性蛋白、非结构蛋白等杂质 |
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温度敏感性 |
2～8℃保存，疫苗免疫效力受温度变化影响相对较小 |
2～8℃保存，疫苗免疫效力受温度变化影响相对较大 |
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生产方法 |
固相合成法 |
细胞培养 |
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鉴别诊断 |
可鉴别野毒与疫苗产生抗体，通过检测血清能判定动物是否发生感染 |
鉴别困难，不能通过检测血清来判定是否发生感染 |
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