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球虫病是由猪等孢球虫和某些艾美耳属球虫寄生于肠上皮细胞引起的原虫性疾病，以发生腹泻为主要临床特征，呈世界性分布，约占仔猪腹泻性疾病中的15%-20%，美国每年导致的经济损失就高达1亿美元以上。它不仅会导致新生仔猪腹泻、消瘦、脱水等，还出现断奶成活率下降、增重缓慢、饲料转化率降低、延长断奶时间、整齐度差等，给养猪生产带来严重的经济损失。
发生猪等孢球虫病后，使用抗生素治疗无效，常被误诊为病毒性腹泻，继而使用大量的抗病药物进行预防，浪费了大量资金又没有达到有效的防控效果，使新生仔猪腹泻现象屡控不止，仔猪的成活率下降，生长缓慢，经济效益受到严重影响。
仔猪球虫病发生因素主要是高度集约化饲养，适宜的温度和易感染的猪群(产房)：
一是高度集约化饲养：密度过高导致球虫病流行越来越普遍，控制非常不易。
二是适宜的温、湿度和最易感的猪群，产房为球虫病的发生提供了最优越的条件，产房污染是仔猪感染的主要来源，并可造成在同一产房内的一窝窝仔猪的连续感染。卵囊常存在于粪便中及产房栏表面，常是前1窝仔猪遗留下来的。一般极少量的残存卵囊即足以导致这种连续感染，1窝仔猪中只要1只感染，很快引起全窝仔猪同群感染，较短的潜隐期和孢子化时间及仔猪栏内较高的温度(可达35℃)，使球虫生活史很易完成，可能是感染在同窝仔猪间迅速扩散的主要因素。
此病在临床上，与细菌性、病毒性等原因引起的腹泻较难区分，容易出现误诊，特别是在疾病后期，仔猪抵抗力下降并发其他疾病感染，如传染性胃肠炎、流行性腹泻、轮状病毒等，使诊断更加复杂和困难，因此，要进行鉴别诊断。传染性胃肠炎、流行性腹泻和轮状病毒感染后的症状与仔猪等孢球虫病有一点类似，但前者传播速度快，仔猪出现呕吐、脱水等现象，死亡率较高;而后者仅仅有腹泻、脱水等，死亡率低。梭菌性肠炎常见于1-3日龄的新生仔猪，7日龄仔猪少见，而且排血痢，而猪等孢球虫病则无血痢出现。另外，猪等孢球虫感染后，使用抗生素治疗无效。
直接刮取空肠和回肠的粘膜，制成抹片染色，在显微镜下，能找到大量内生发育阶段的虫体(裂殖子、裂殖体和配子体)。或者是采用饱和盐水漂浮法检查粪便中的球虫卵囊，但是由于仔猪粪便内含油脂较多，难于分辨卵囊和脂肪泡，检出率不高。
控制球虫病的中心应围绕着怀孕和产仔设施的卫生和产前母猪的治疗，基本前提是防止新生仔猪吃入虫卵，而清除环境中的球虫卵囊和避免卵囊污染猪舍是防治本病的关键。但是一般的消毒剂不能杀灭孢子化卵囊，只有以甲酚为基础的消毒剂可有效破坏球虫卵囊。为了减少母猪排出的卵囊污染环境而增加仔猪感染的机会，可在产前2周和产后2周在母猪料中添加有效抗球虫药物，但控制仔猪腹泻的效果不显著。在仔猪出生后2-5天灌服“仔猪专用型球必清”(主要成分地克珠利、蒙脱石，华南兽医)进行预防，在广东、浙江等地区的大型猪场已经收到了较良好的效果
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