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鸭瘟和鸭霍乱是鸭的两种危害性极大的传染病。鸭瘟是由滤过性病毒，鸭霍乱是由禽巴氏杆菌引起的，发病率和致死率都很高。此两种病常并发流行，均有体温升高、精神萎糜、羽毛蓬松等相似症状，因此诊断时要注意区分。鸭瘟（新城疫）和鸭霍乱的区别在于：
1．从流行病学的特点比较。
鸭瘟仅引起鸭、鹅自然发病，流行期比较长，当鸭瘟传入一个易感鸭群时，一般在37天后开始出现零星病鸭，再过3～5天才开始大批发病，整个流行过程可达半个月至一个月，死亡率平均在90%以上。而鸭霍乱在各种家禽中包括鸭、鸡、鹅、火鸡和鸽均可感染，甚至传染给猪。病程短促，一般在数小时至2天内死亡。雏鸭常呈流行性发病，死亡率可达80%以上。成鸭多为散发性流行，其流行呈间歇性。
2．从临床症状的特点比较。
鸭瘟症状特点是流泪、眼睑肿胀，两脚发软不能站立，下痢、头颈部肿大，俗称“大头瘟”。而鸭霍乱最急性病例可无任何症状而突然死亡。急性病例呈现精神萎顿，食欲停止，呼吸困难，口腔和鼻孔有时流出带泡沫粘液，有时流出血水，频频摇头，很快死亡，俗称“摇头瘟”。
鸭瘟的病鸭，流涕流泪，死亡时眼睛充血，嗉囊空虚无食物，手摸时感到松软；而患鸭霍乱病的病鸭，死亡前常摇头，死亡时口、鼻流稀血水，嗉囊里充满饲料，手摸感觉硬实。
鸭瘟病者，翻开鸭肛门，出现充血，水肿或有黄绿色假膜，拉白灰色、灰色或铜绿色粪便；而鸭霍乱拉红色、淡红色或棕色恶臭粪便。
3．从解剖的特点比较。
鸭瘟病例食道和泄殖腔粘膜有黄褐色假膜覆盖，腺胃粘膜出血或坏死；而鸭霍乱在胸膜腔的浆膜，尤其是心冠沟和心外膜有大量出血点，脾脏常呈樱桃红色。最具特征的是整个肝脏表面散布着灰白色针头大较规则的坏死点，肺脏常呈现弥漫性充血、出血和水肿。
4．从药物治疗效果比较。
抗菌素和磺胺类对鸭瘟无效，而对鸭霍乱有很好的疗效。若鸭患的是鸭瘟，在确诊后唯一的办法就是注射鸭瘟疫苗。但应注意，凡体温升高至42．5℃以上者不应注射，应先大群投药，“清瘟败毒散”拌料，“禽疫威”饮水，连用3～4天，“旺补多维电解质”全天饮用一疗程，再注射鸭瘟疫苗，效果较好。
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