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同一猪场的疫情达到稳定的时间是否相似？哪些因素会影响达到稳定的时间？
达到稳定的时间
达到稳定的时间（TTS）是猪群在疾病爆发后，达到繁殖和呼吸综合征（PRRS）病毒PCR阴性仔断奶猪所需的时间。TTS是量化病毒排毒持续时间，计划猪群隔离时间和评估种猪群中所使用干预措施的重要手段。Holtkamp等人致力于标准化分类标准和测试策略（2011），他们建议30头断奶仔猪连续4次检测出阴性的PCR结果， 30天后将猪群认定为阳性稳定。必须强调的是，稳定性并不意味着阴性。稳定性的概念为，尽管在断奶仔猪中使用建议的检测方法无法检测到病毒，但该病毒仍然可能在猪群中低水平存在。
什么因素可影响达到稳定的时间
LLinhares等人（2014年）观察到，疾病爆发后，使用活疫苗接种（LVI）比使用改良活疫苗接种的猪群早7周达到稳定。此外，有PRRS爆发史的猪群比没有PRRS病史的猪群早三周达到稳定。
病毒可以用三个数字进行分类，这三个数字由三种酶切割PRRS病毒基因组的位置决定。这种命名法称为限制性片段长度多态性（RFLP）模式。在2014年美国出现1-7-4型RFLP模式后，报告显示，在发生1-7-4型疫情的猪群中，TTS增加。最近，我们的小组观察到，1-7-4型暴发的TTS比其他RFLP模式暴发的长（Sanhueza等人，2018年），这与先前的观察一致（Linhares等人，2017年）。值得注意的是，发生在春季/夏季的PRRS疫情的TTS明显长于发生在秋季/冬季的疫情（图1）。
图1：根据爆发季节观察到的PRRS到达稳定的时间。虚线表示总平均值（43.9周）。每个框代表50%的数据（百分位25-75），框中的黑线代表中间值（百分位50），故每个季节，一半的疫情在这条线以上，另一半在这条线以下。
TTS在不同公司之间存在显著差异（Linhares等人，2014年），且同一公司的不同猪场间以及同一猪场不同次疫情爆发间的TTS也可能存在差异。然而，关于这些变异的来源和相对重要性的信息很少。
同一猪场不同次疫情爆发间的TTS相同么?
为了回答这个问题，我们与位于美国中西部的六家公司合作。这些公司用相似的方法将猪群定义为PRRS稳定，并由Holtkamp等人指导（2011）。用2011-2017年期间报告的PRRS疫情计算TTS。为了比较同一个猪场的TTS，本次分析只选择了至少发生两次PRRS疫情的猪场。
总的来说，研究共包括53个猪场发生的133次疫情，其中大多数猪场（n=35）发生了两次疫情。11个猪场发生了3次疫情，5个猪场发生了4次疫情，2个猪场发生了5次疫情。在大多数疫情中，用活疫苗接种全体暴露猪群作为干预措施（110/117次疫情）。总的TTS平均值为43.9周（最后一次阴性PCR试验）。
图2显示了在53个猪场观察到的PPRS暴发的TTS。同一猪场内不同爆发的平均TTS差异为25.7周，范围在0-160周之间。虽然我们考虑了影响TTS的几个因素（即季节、RFLP模式、爆发年份、PRRS爆发史以及用于使猪群同质化的干预措施），但在同一个猪场中，大多数TTS的变异仍然发生在爆发之间。换言之，同一猪场在不同时间点发生的两次给定疫情的TTS大不相同（图2），这种差异可能归因于猪场特定的内在因素。公司间TTS差异对TTS变异性影响较小。
图2：美国中西部53个种猪群达到PRRS稳定的时间。每个点代表在给定猪场的每次暴发中观察到的TTS。
还有什么其它因素可以解释同一猪场两次或两次以上疫情爆发达到稳定时间的差异？
尽管病毒特征（如RFLP模式）、实施的疫情干预措施、疫情发生的季节以及公司对TTS的影响，但同一猪场的两次PRRS疫情的TTS可能存在很大差异。因此，同一个猪场的疫情爆发可能会存在较短和较长的TTS，这解释了生产者和从业者在努力实现稳定时的挑战。这些结果表明，与每次暴发相关的其它未测量因素（如暴发管理、暴发季节、猪场管理人员/工人的经验或培训、实施的控制措施和内部生物安全）可能对TTS产生更大的影响，并有助于进一步解释同一个猪场不同疫情爆发间TTS的巨大差异。
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