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根据全球ORF5序列完善PRRSV-2基因分类并研究其地理分布和时间变化
现代畜牧网 http://www.cvonet.com 2024/8/3 9:51:39 关注：178 评论： 我要投稿
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本研究完善了PRRSV-2 ORF5的系统发育分类，并在谱系/亚谱系水平上研究了PRRSV-2的地理分布和时间变化。
猪繁殖与呼吸综合征病毒 (PRRSV) 是影响全球养猪业的重要猪病原体。十多年前提出了第一个基于开放阅读框5 (ORF5) 的遗传谱系分类系统，该系统概述了全球PRRSV-2遗传多样性。尽管已经针对美国的主要谱系（谱系 1）提出了改进方案，但自2010年以来，国际层面的PRRSV-2系统发育分类系统尚未得到彻底评估和更新。
方法：本研究基于对1989年至2021年期间报告的82,237个全球 ORF5序列的分析，我们将PRRSV-2分为11个遗传谱系（L1-L11）和21个亚谱系（L1A-L1F、L1H-L1J、L5A-L5B、L8A-L8E和L9A-L9E）。
结果：如果需要添加更多谱系、亚谱系或更细的分类，所提出的分类系统具有灵活性。例如，为了进行更精细的流行病学调查，L1C进一步分为五组（L1C.1-L1C.5），其中L1C.5对应于最近出现的L1C变体。限制性片段长度多态性 (RFLP) 分型与系统发育分类之间的比较表明，在大多数情况下使用RFLP确定PRRSV-2遗传相关性是不准确的。确定了六种商品PRRSV-2疫苗与各谱系/亚谱系的遗传同源性以及疫苗样病毒的检测频率。介绍了各谱系/亚谱系的全球地理分布。通过分析73,092个ORF5序列，研究了1989年至2021年美国PRRSV-2的时间动态变化。
结论：总之，本研究完善了基于PRRSV-2 ORF5的系统发育分类，并在谱系/亚谱系水平上研究了PRRSV-2的地理分布和时间变化。本研究中完善的分类系统和分子流行病学数据对于未来PRRSV-2的表征具有重要价值。
Yim-im W, Anderson TK, Paploski IAD, VanderWaal K, Gauger P, Krueger K, Shi S, Main R, Zhang J. 根据全球ORF5序列完善PRRSV-2基因分类并研究其地理分布和时间变化。 Virology. 2023. https://doi.org/10.1128/spectrum.02916-23
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| 文章来源：pig333世界猪业之窗 文章编辑：一米优讯 |
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