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导读：近年来的研究显示，抗生素的广泛使用促进了耐药基因（ARGs）向环境中的传播。土壤是ARGs最大的环境储存库之一，AGRs进入土壤的一条重要途径是通过畜禽粪肥应用。畜禽粪便在用于农业种植之前进行的堆肥处理并不能彻底清除细菌携带的耐药基因。这类应用也会促进ARGs在粪便源细菌与土壤中携带移动基因元件（如宿主广泛的质粒、1型整合子等）的微生物之间的水平传播。特别值得关注的是，在这类土壤中生产的蔬菜类植物存在ARGs水平显著上升的风险。因此，从公共卫生的角度来看，有必要充分了解畜禽粪肥中的ARGs在土壤-植物系统中的确切转移路径，从而有助于准确评估植物耐药组（Microbime）向人的食物链转移的风险。
《Environmental International》2019年6月17日在线刊发了澳大利亚墨尔本大学与西悉尼大学的科研人员就畜禽粪肥在土壤中的应用对土壤耐药组和生菜微生物组影响的研究结果。在这个研究中，研究人员将生菜分别种植在添加家禽和牛粪肥的土壤中，90天后收获，采集生菜不同部位进行细菌和耐药基因检测。定量PCR结果显示，共检测到144种ARGs，与根内、叶内、叶围等部位相比，根围土壤样品中检出的ARGs最多样。牛粪肥的应用增加了根内生菌的ARGs丰度，而家禽粪肥的应用则提高了土壤、根内生菌和叶围细菌的ARGs丰度，并且前者的数量和丰度显著低于后者。进一步的分析显示，耐药基因谱与细菌类群显著相关，来自厚壁菌门、Chloroflexi、酸杆菌门、芽单胞菌门、变形菌门等的细菌与生菜耐药组丰度显著相关。研究人员认为ARGs从应用粪肥的土壤转移到生菜不同部位存在着内部和外部两条路径。基于土壤-植物系统的ARGs共享事实，研究人员推测ARGs可通过食物链转移至人的微生物组和病原体。
注：内生菌是生活在健康植物的各种组织和器官的细胞间隙或细胞内并且宿主植物不表现出感染病状的一类微生物。叶围细菌是指植物叶片表面的细菌，也称为叶面细菌、附生细菌、居留细菌。
文章来源：ZHANG Y J, HU H W, CHEN Q L, et al. Transferof antibiotic resistance from manure- amended soils to vegetable microbiomes[J/OL].Environmental International, 2019[2019-06-17]. https://doi.org/10.1016/j.envint.2019.104912.
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