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科学家破解中国禽流感动态传播与活禽贸易之间的联系


现代畜牧网 http://www.cvonet.com 2020/3/12 0:58:53 关注:267 评论: 我要投稿

作者重建了1996年以来H5N1病毒在中国的传播动态数据,结合病毒基因组,将数据与新近出现的其它高致病性亚型进行比较。发现,AIV传播模式和中国家禽贸易网络关系十分密切。

本次中国新冠疫情逐渐接近了尾声,大家的生活工作正在走向正轨。企业开始复产复工、上下班也出现早高峰,一切都在往正常的轨道行进。只是路上的行人依然都戴着口罩,证明大家对疫情个人处理的重视。然而在新冠疫情发生的过程中,还重叠了多起高致病性禽流感疫情。
2020年至今我国禽流感疫情汇总

日期
禽流感类型
地区
发病(羽)
死亡(羽) 扑杀(羽)
2月9日
H5N6 四川
1840
2261
2月1日
H5N1
湖南
4500
17828
1月21日
H5N6
新疆 9
19

1月20日
H5N6 新疆 13
13
1月16日
H5N6
新疆 1
1

1月8日
H5N6
新疆
15
15

疾病面前,众生平等。瘟疫来袭,一样脆弱,一样无助。

禽流感与活禽交易之间的联系

活禽贸易,在亚洲HP AIVs的传播和维持中发挥着重要作用。但家禽贸易是如何大面积传播AIV的呢?这依然扑朔迷离。
北京师范大学全球变化与地球系统科学学院,遥感科学国家重点实验室的Qiqi Yang等人,联合国内外多家机构,近期在PNAS上发表《Assessing the role of live poultry trade in communitystructured transmission of avian influenza in China》文章,评估了中国禽流感动态传播与活禽贸易之间的联系。
作者重建了1996年以来H5N1病毒在中国的传播动态数据,结合病毒基因组,将数据与新近出现的其它高致病性亚型进行比较。发现,AIV传播模式和中国家禽贸易网络关系十分密切。
H5N1、H7N9和H5N6的血凝素(HA)基因系统系谱显示,病毒在不同地点间频繁移动,显示出明显的地理混合。而随距离增加,病毒谱系转化率降低。但也观察到一些长距离移动现象,特别是进/出吉林、新疆(H5N1和H7N9)和宁夏(仅H7N9)等北部省份。

H5N1 (A)、H5N6 (C)和H7N9 (E)在中国家禽中的传播,H5N1 (B)、H5N6 (D)和H7N9 (F)的跨省病毒谱系转化率随距离增加而降低
病毒传入和传播的流行病学后果取决于家禽贸易网络的结构。为此,作者评定出了五个活禽贸易区(LPTC):东、西、南、东北、中北。

 

灰色/黑色曲线表示省际活禽贸易的流动性,颜色越深流量越高。
    下图形见证了三种亚型的变迁史。H5N1亚型最初在南方发生 (LPTC-1),随后到东南部(LPTC-2)和中北部(LPTC-4) 开枝散叶(A)。H7N9和H5N6也类似(B和C)。来自东南部(LPTC-2) 的H7N9病毒最终分化成了两支:长江三角洲系(LPTC-2)和珠江三角洲系(LPTC-1)。H7N9在这些传播扎根了三年多,造成了四波流行。不过,H7N9在第五波时远走他乡,从LPTC-1传播到中国各地。而尽管H5N6显示了蠢蠢欲动的外流冲动,但主要还是较为安分守己地呆在LPTC-1和LPTC-2内搞事情。
野生鸟类也会传播病毒,它们在越冬和繁殖地之间迁徙,中途稍事停留。但每一次的停留,都为病毒在当地水禽、哺乳动物和环境的传播埋下了危险的火种。由此,病毒家族通过鸟类迁徙可能出现远距离扩散,比如最近的H5N8全球传播。

H5N1 (A)、H5N6(B)和H7N9(C)禽流感病毒的空间传播动态
作者发现,相同LPTC的病毒转化率(H5N1的平均值为1.08;H5N6平均值= 1.06;H7N9平均= 1.07)高于省际(H5N1平均= 0.98;H5N6均值= 0.98;H7N9 = 0.97)。随后的随机化测试也正如所料,转换率结果并无二致。此项测试证实了LPTCs能很好解释AIV的各种血统在中国大地上的繁衍生息。
该研究结果为了解亚洲AIV谱系的前世今生提供了见解,并可能有助于预测其他地区AIV毒株的冒头,对制定AIV预防和控制战略提供了宝贵的意见。

结 语

容易变异是流感病毒的天性,新毒株就有可能引发新的流感大流行。人类历史上 1918年流感大流行的直接原因可能就是纯禽流感病毒变异造成,而1957、1968 年的两次流感大流行均系人流感病毒与禽流感病毒的重配。

参考文献:
1. Yang, Q., et al., Assessing the role of live poultry trade in community-structured transmission of avian influenza in China. Proc Natl Acad Sci U S A, 2020 DOI: 10.1073/pnas.1906954117.
2. 刘春艳,艾军红. 甲型 H7N9 禽流感病毒的病毒学特征 [J]. 中国当代儿科杂志,2013(06):405-408.
作者:觅元素MIElement

文章来源:国际畜牧网     文章编辑:一米优讯     
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