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H7N9禽流感病毒
对人类宿主的适应性研究
Swan Tan，Muhammad Farhan Sjaugi，Siew Chinn Fong，Li Chuin Chong，Hadia Syahirah Abd Raman，Nik Elena Nik Mohamed，Joseph Thomas August ，Asif M KhanPMID:34068495 PMCID: PMC8150935 DOI: 10.3390/v13050871H7N9禽流感病毒在禽类宿主中传播数十年后，于2013年被确定为人畜共患病原体。本文通过比较2014年和2017年报告的4706条禽类和人类感染H7N9禽流感氨基酸序列，确定了可能对人类感染至关重要的氨基酸突变位点。结果显示，2013年仅发现17处位点突变可能对人类最初的适应至关重要，但截至2014年，共发现109处禽-人（A2H）特异氨基酸突变，且这些突变大多数在H7N9的进化过程中长期存在。值得注意的是，H7N9禽流感病毒的持续进化导致了禽类病毒和人类病毒的蛋白质序列几乎完全相同。
H7N9禽流感病毒对人类宿主迅速而持续地适应将会增加人类感染的风险。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34068495/
我国2014-2018年
环境禽流感病毒分布分析
Hong Bo，Ye Zhang，Li-Bo Dong，Jie Dong，Xi-Yan Li，Xiang Zhao，Zi Li，Yue-Long Shu，Da-Yan WangPMID: 33957986 PMCID: PMC8101199 DOI: 10.1186/s40249-021-00850-3了解禽流感病毒（AIV）在家禽和野生鸟类相关环境中的分布对于禽流感疫情防控至关重要。本研究分析了我国31个省（自治区、直辖市）AIV的地理和季节分布情况，分析了我国环境中AIV亚型的多样性。
2014-2018年，从我国大陆不同地区的家禽和野生鸟类相关环境中采集了742 005份环境样本。从环境样本中提取病毒RNA，对所有样本进行流感A、H5、H7和H9亚型的实时RT-PCR检测。将A型流感阳性样本接种鸡胚中进行病毒分离，然后通过Illumina平台进行全基因组测序。采用SPSS软件进行配对t检验，使用ArcGIS绘制分布地图。结果显示，A、H5、H7和H9亚型的核酸阳性率表现出不同的地理分布特征：我国中部、东部、南部、西南部和西北部的11个省份，A型流感的核酸阳性率最高（25.96%-45.51%）；我国西南部和中部的两个省和一个直辖市，H5亚型流感的核酸阳性率显著较高（11.42%-13.79%）；我国东部和中部五个省份的H7亚型核酸阳性率高达4%；我国南部、东部、中部、西南部和西北部的11个省（自治区、直辖市）中，H9亚型的核酸阳性率较高（13.07%-2.07%）。A、H5、H7和H9亚型的核酸阳性率表现出相同的季节性：在12月和1月阳性率最高，5月至9月阳性率最低。从活禽市场（LPM）（30.42%、5.59%、4.26%、17.78%）和家禽屠宰场（22.96%、4.2%、2.08%、12.63%）采集样本中检测到的A、H5、H7和H9亚型流感病毒的核酸阳性率显著较高。从污水和砧板收集的环境样本中，A（36.58%和33.1%）、H5（10.22%和7.29%）、H7（4.24%和5.69%）和H9（21.62%和18.75%）的核酸阳性率显著较高。从环境样本中分离出多种AIV亚型，包括9种血凝素（HA）和7种神经氨酸酶（NA）亚型。H5、H7和H9亚型占环境中AIV的大多数。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/33957986/
2021年9月-12月欧盟禽流感流行概况
European Food Safety Authority, European Centre for Disease Prevention, Control, European Union Reference Laboratory for Avian InfluenzaPMID: 34987626 PMCID: PMC8698678 DOI: 10.2903/j.efsa.2021.71082021年9月16日-12月8日，27个欧盟/欧洲经济区国家和英国在家禽（316）、野生鸟类（523）和圈养鸟类（28）中检测到867株高致病性禽流感病毒（HPAIV）。家禽中的病毒主要由意大利（167）报告，其次是匈牙利和波兰（各35）。野生鸟类中的病毒主要由德国（280）、荷兰（65）和英国（53）报告。候鸟和留鸟中HPAIV的持续存在和传播，将在今后一段时间对欧洲的家禽业造成持续威胁。遗传分析结果表明，本报告所述期间的病毒属于2.3.4.4b进化枝。在瑞典、德国、波兰和英国检测到的HPAIV（H5N1）与2020年10月之后在欧洲传播的病毒有关。从2021年10月开始，北欧、中欧、南欧和东欧已引入新型重组H5N1病毒。在瑞典、爱沙尼亚和芬兰的野生哺乳动物中也发现了高致病性H5N1病毒。欧盟/欧洲经济区一般人群的感染风险评估为低，职业接触人群的感染风险为低至中等，但由于禽类传播方式的高度多样性，风险评估结果仍存在很大的不确定性。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34987626/
H9N2禽流感病毒与人H1N1流感病毒
重组后PB1基因的亲和性和突变率变化研究
Hongrui Cui，Guangsheng Che，Mart C M de Jong，Xuesong Li，Qinfang Liu，Jianmei Yang，Qiaoyang Teng，Zejun Li，Nancy BeerensPMID: 35078489 PMCID: PMC8788113 DOI: 10.1186/s12985-022-01745-x人类流感病毒和禽流感病毒（AIV）之间重组可能会产生具有新特征的新型病毒，这些病毒可能在下一次流感大流行时威胁人类健康。在本项研究中，研究人员调查了H9N2禽流感病毒与人类H1N1流感病毒重组后PB1基因的亲和性和突变率的变化。
用荧光素酶报告基因法检测病毒核糖核蛋白（RNP）复合物的聚合酶活性，该聚合酶由不同重组事件衍生的相关基因片段组合而成。重组病毒通过反向遗传学技术产生。在不用细胞系和小鼠肺中传代五代对重组病毒进行生长动力学和毒力研究，利用下一代测序技术（NGS）分析不同传代途径下子代病毒PB1基因突变率的变化。结果发现，重组病毒能够在MDCK、DF1细胞和小鼠中连续复制。对NGS数据的分析表明，PB1重组病毒的突变率提高。
PB1重组病毒具有较高的聚合酶活性和突变频率，提示H9N2禽流感病毒的PB1基因可能驱动重组病毒对人类宿主的进化和适应。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35078489/
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