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种鸡的孵化率不仅与种蛋本身有关，而且也与日常的孵化管理有关。加强对种蛋的日常管理也可提高种蛋孵化率。
种鸡管理分项很多，就现状养殖朋友们比较容易忽视的薄弱环节是场区的卫生消毒与种鸡利用年限。
科学家告诉我们并不是所有的病原感染都能引起发病，只有一定数量病原体在环境和机体内积起来，其数量达到或超过机体所能抵抗的极限时，鸡群才会发病。除了外界侵入的病原体外，种鸡自身又是重要的污染源。鸡群通过呼吸、排泄、皮肤分泌物等向外界大量排泄病原体。
因此，在病原积累期，严格的隔离，科学的免疫，加上彻底的消毒，从而使病原体来不及积累足以致病的数量，来不及侵入种鸡和种蛋内就被杀灭，人为地延长病原积累期或促成传染病停滞在病原积累期，是保障种鸡健康，保证高孵化率和健雏率的重要措施。
种母鸡在28-58周龄间所产蛋的种用合格率、受精率、孵化率高，28周龄前蛋重小。一些种鸡场在种鸡利用年限上走两个极端，一头是提早挖潜，竭泽而渔，不顾种鸡日龄、体况、产蛋率、蛋重提早输精种用，导致种母鸡输卵管和泄殖腔发炎，产蛋率上升迟缓，因蛋重轻和畸形蛋多，使种蛋合格率、孵化率、健雏率低。
另一头则是延长年限，勉强种用。正确的方法是采用周期内全进全出制，也可以采用老母鸡×新公鸡，新母鸡×老公鸡交替配种的方法，效果也可以。种公鸡日粮还要及时补足VA、VE。种蛋管理主要包括选择，早期消毒，时间和温湿度控制等。
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