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病理解剖检查是运用解剖学的知识，通过对尸体病变的诊察、识别与判断而对疾病做出初步诊断的一种方法。通过剖检可以为临床上确诊疾病提供依据。
剖检前的体外检查 先检查病死鸡的营养状况和外观，羽毛是否整齐，鸡冠及肉髯和面部是否有痘斑或皮疹，口、鼻、眼有无分泌物或排泄物；泄殖腔是否被啄伤、脱肛，附近是否被粪便污染或白色粪便阻塞；鸡爪皮肤是否粗糙、裂缝、有石灰样物附着，爪底是否有趾瘤等。注意腹部及嗉囊表面皮肤的颜色，观察有无变化或损伤。
剖检顺序及观察内容 外部检查完毕后，将病死鸡置于干净的搪瓷盘内，先用消毒药水将羽毛擦湿，将连接腹壁与两侧腿部的皮肤剪开，用力将两大腿向外翻转，直至股关节脱臼，尸体即可平稳地停放。用剪刀分别沿上述腹部两侧的切线将皮肤向前剪至胸部，另在泄殖腔腹侧皮肤作一横的切线，使与腹侧切线相接，用手在泄殖腔腹侧切口处将皮肤拉起，向上向前拉，使胸腹部皮肤与肌肉完全分离。这时可检查皮下是否有出血，胸部肌肉的黏稠度，肌肉的颜色，是否有出血点或灰白色坏死点等。
在泄殖腔腹侧将腹壁横向剪开，再沿肋骨后缘交接处向前剪开腹肌，然后一只手压住鸡腿，另一只手握龙骨突后缘向上向前翻拉，露出胸腔和腹腔，先察看气囊膜有无混浊、蜡厚或被覆渗出物等，其次注意胸腔或腹腔内的液体是否增多，器官表面是否有胶冻状或干酪样渗出物等。
摘除各个器官，首先剪开心包囊，检查心包液的分量和性状，注意心包囊是否浑浊或有纤维性渗出物黏附，心包液是否增多，心包囊与心壁是否粘连等。检查完毕后摘除心脏；然后依次将肝脏、腺胃、肌胃、肠管、胰、脾一起摘出，肺紧贴肋骨而陷入两侧的肋间隙中，肾脏位于脊柱两侧而嵌入腰荐骨横突之间，可以用手术刀柄剥离，逐一检查上述摘除器官。用剪刀将下颌骨、食道和嗉囊剪开，注意食道、嗉囊黏膜的变化，检查嗉囊内容物的性状，剪开喉头气管，注意黏膜及管腔内分泌物。
为了对鸡病做出确诊，除了上述方法提供的依据外，还可以借助于实验室内的一些方法，如微生物学诊断、寄生虫学诊断、毒物检验、饲料营养成分分析等。
近几年来，随着我国养鸡业的发展，抗微生物药物尤其是抗菌药物已成为兽医临床上使用最广泛和最重要的抗感染药物。抗微生物药物在保障养鸡业健康发展的同时，也不可避免地带来一些负面影响，如抗菌药物的不合理应用，特别是滥用，不仅造成了药品的浪费，而且也给治疗、公共卫生和人类健康带来了严重的问题，如鸡的不良反应增多、二重感染、细菌耐药性的产生、鸡产品中的兽药残留以及人们食用这些有兽药残留的食品而出现的过敏反应等等。为了最大程度地发挥抗微生物药物的效果，降低毒副反应，减少微生物耐药性的产生，提高药物治疗水平，降低药物残留，必须合理使用抗微生物药物。
抗微生物药物包括抗菌药、抗真菌药和抗病毒药。
抗菌药包括抗生素和化学合成的抗菌药。抗生素是指某些微生物(细菌、真菌、放线菌等)在生活过程中产生的具有抗病原菌作用和其他活性的一类物质，现在使用的抗生素除了从微生物的培养液中提取获得外，有些品种还可以用半合成或合成法制造。抗菌药物和抗生素是临床上常用的名词，且常彼此混用，但抗菌药包含的范围显然要比抗生素广，并且抗菌药包括抗生素。
抗生素根据其化学结构又可以分为以下几类。
β-内酰胺类包括青霉素类和头孢菌素类，青霉素类有青霉素、氨苄西林、阿莫西林等，头孢菌素类有头孢氨苄、头孢唑啉、头孢噻呋等，头孢菌素类药物由于广泛应用于人医和其价格比较高昂，在兽医上多用于宠物，而很少应用在养鸡上。在养鸡上应用比较广泛的青霉素类药物是氨苄西林和阿莫西林，氨苄四林和阿莫西林对大肠杆菌、沙门氏菌、巴氏杆菌(引起鸡霍乱)等有较强的作用，可用于治疗鸡大肠杆菌病、鸡白痢和鸡霍乱等。
氨基糖苷类 有链霉素、卡那霉素、庆大霉素、阿米卡星(丁胺卡那霉素)、新霉素、大观霉素、安普霉素、潮霉素、越霉素A等。链霉素主要用于防治禽霍乱、禽伤寒、副伤寒、鸡白痢、鸡大肠杆菌病、鸡传染性鼻炎、霉形体等；卡那霉素用于治疗大肠杆菌病、禽伤寒、副伤寒、鸡白痢、坏死性肠炎、葡萄球菌病、霉形体等；庆大霉素用于治疗大肠杆菌病、沙门氏杆菌病、葡萄球菌病、霉形体等；阿米卡星的作用同庆大霉素；新霉素用于治疗肠道大肠杆菌感染；大观霉素可用于鸡的大肠杆菌病、禽霍乱、禽沙门氏菌病和败血支原体引起的鸡慢性呼吸道病；安普霉素主要用于禽的大肠杆菌病和沙门氏菌病。
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