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畜禽舍的环境安全问题，其中疫病预防与臭气控制问题属于是当前养鸡场以及新建养鸡场必须考虑的问题。我们很清楚防疫的难度，也尽力做了许多工作，但危害严重的疫病仍然肆虐横行，禽流感、鸡瘟等仍是挥不去的阴霾。环境问题随着人们对生活质量要求的不断提出，村中、城郊养鸡散发的臭气又成为环评的重要指标，一些大型养鸡场的建设也因为臭气的处理没有考虑而停建或下马，因此臭气的治理又成为鸡场建设的另一难题。
1．疫病预防的问题
空气传播、接触传播是造成养鸡业损失的最重要外来疫病传播方式，危险的微生物气溶胶可以通过气流、沉降粘附再以接触传播的方式传播疫病，危险的微生物气溶胶的来源与传播方式。传统的预防是建立在疫苗、治疗性兽药以及一些消毒措施基础之上的，其中，疫苗是第一位的，药物治疗则是发病后的无奈之举，至于一些消毒措施则是辅助性的，很多小型、散养的养殖户根本就免除了常规的消毒。
在众多的依靠空气传播或空气与接触混合传播的突发疫病中，尤其是新病原或多种病原引发的疫病通常是很难预防的，即使查明了原发病原，但足够量的疫苗生产往往需要较长的时间，而针对新病原的疫苗研制肯定是落后于疫病暴发的，对多种病原的多重感染采取疫苗预防其效果更具不确定性，因此，疫苗不是万能的甚或是形成更大疫情的祸首，依靠疫苗实现鸡场的预防目标是不保险的，这一观点是养鸡场防疫体系建设必须牢记的。
药物治疗是一般点发性疾病的治疗方法，对于病毒性或大多数突发性群体疫病的防治往往无效，因此，药物治疗仅是降低日常微小损失的补救措施，不能成为鸡场防疫建设依托的重点。
常规的消毒包括喷雾消毒、消毒池、撒石灰、紫外灯等，就相关的效果评价来讲，喷雾消毒、紫外灯只是一天中某时刻的使用，日消毒防疫效果不理想。消毒池、撒石灰仅仅是控制了移动媒介下端部分的病原扩散，而对上部却无效。我们知道，危险空气微生物的侵袭具有随机的多方位、不确定时段的时空特征，即随时随地都会以多种渠道侵袭，比如可以以气溶胶的形式从鸡舍的通风口进入，也可以粘附于运输器具、饲养员衣服上而“搭顺车”传播的，还可以通过病鸡咳嗽、排便、抖羽形成的气溶胶扩散等。因此，这几种消毒方式无论如何组合，其防疫效果都不会理想的。
通过空气传播、接触传播的疫病并不能依靠传统的消毒措施以及现有疫苗、药物进行有效的预防，这是当前养鸡业难以健康发展的本质原因。
如何建立有效的防疫体系是全球设施养殖业几十年来一直探索的核心议题。环境安全型鸡舍概念的提出推动了工程防疫技术的发展，也催生了防疫的自动技术。一个封闭的舍加一个特殊的空气净化灭菌系统就能组成一个基本的环境安全型鸡舍。
2．鸡场的臭气控制问题
畜禽养殖场恶臭污染物排放浓度虽然有了国家标准（GB18596）的规定，但臭气治理技术一直没有比较好的、适用的技术。沸石、膨润土等物理除臭以及高锰酸钾、重铬酸钾、次氯酸钠等化学除臭都有很大的局限性，利用微生物发酵的生物除臭法仍然没有运营成熟的例子。
臭气之所以难以控制就在于臭气在空气中的浓度一百万分（ppm）甚至是以十亿分(ppb)为计量单位的，即使总量十亿分之几，但其臭气感觉强烈，使得身处其中的人感觉非常不愉快。这里我们不讲粪便出舍后再处理形成的臭气污染，因为有比较好的封闭设施来集中处理这些粪便，化学的方法往往在这里使用最为有效的。我们关注的是鸡舍本身的环境安全与臭气治理，每一鸡舍单元做好了，鸡场剩余的工作就会很顺利的。
我们知道，鸡舍内最重要的臭气包括挥发性脂肪酸、粪臭素、氨气等。鸡舍内部和鸡舍周围的这些臭气刺激强度与其浓度、混合后的独特气味、尘埃紧密相关。
鸡舍臭气成分完全是有机气体，对外界影响最大的臭气就是挥发性脂肪酸、粪臭素、氨气等，单纯的气体可以从鸡舍与外界相通的任何空隙溢散出去，几乎所有的传统鸡舍都无法控制这种溢出。
环境中的尘埃也可影响人们对臭气的感知量和传播距离。臭味气体可被吸附在尘埃粒子之上而随风传播到远处，在尘埃离开鸡舍之后其上的臭气就会缓慢地释放出来。因此，尘埃飞扬的鸡舍就比尘埃较少鸡舍更令人讨厌。决定鸡舍尘埃量的因素包括鸡的活动、气温、空气的相对湿度、通风率、饲养密度以及饲料的浪费程度。尘埃既可携带微生物也可携带臭气，因此，可将控制尘埃作为减少臭气的主要措施是符合饲养者和周边居民的最大利益的。一项经典的研究表明，鸡舍中的尘埃80～90%来自饲料，2～8%来自垫料，2～12%来自鸡体本身。舍内尘埃的控制过去常采用通风的方法，但从节能和防疫两个角度考虑，都存在着不合理性，况且排出的尘埃、臭气又是周边居民讨厌的大气污染物。
如何有效地控制臭气的扩散以及降低舍内臭气浓度是现代养鸡场建设必须考虑的问题。能够从根本上解决鸡舍臭气问题的只有将鸡舍封闭起来，舍内、进气与排气口三个地方实施空气除臭处理。
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