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我国首款地方鸡遗传资源保护与品种鉴定液相芯片“酉芯一号”研发成功
现代畜牧网 http://www.cvonet.com 2022/9/2 7:26:15 关注：844 评论： 我要投稿
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种业创新是国家的核心战略，遗传资源是种业创新的重要物质基础。针对现实需求，江苏省家禽科学研究所韩威研究员团队研发成功“酉芯一号” 基因分型液相芯片，填补了我国地方鸡遗传资源保护与品种鉴定领域专用芯片的空白。
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“酉芯一号”芯片
中国首款地方鸡遗传资源保护与品种鉴定基因分型液相芯片中国是世界家禽资源大国，拥有丰富多样的家禽遗传资源，地方家禽品种众多，加强家禽遗传资源保护是维护国家种业安全的战略需要。基于地方鸡遗传资源保护与品种鉴定的现实需求，“酉芯一号”液相芯片由江苏省家禽科学研究所韩威研究员团队研发成功，这是国内首款地方鸡遗传资源保护与品种鉴定的基因分型液相芯片。
据江苏省家禽科学研究所副所长、研发团队负责人韩威研究员介绍：国内现已发布了两款鸡育种专用芯片，“京芯一号”和“凤芯一号”，但在地方鸡遗传资源保护与品种鉴定领域缺少专用芯片。目前，我国各级地方鸡保种场、基因库保种效果评价方法各异，导致难以在统一标准尺度下科学评价群体状况和变化；在品种鉴定上，亦是如此。因此，科研团队从两方面考虑：一是选取代表性品种素材，优选可靠性位点；二是制定相应的位点分析标准化技术，提高群体评价与品种鉴别的准确性。“酉芯一号”芯片的成功研制极大地降低了基因组分型成本，有利于芯片的规模化应用，为地方鸡遗传资源保护和精准鉴定提供了有力的核心技术支撑和保障。
综合考虑品种生态地理区域分布、经济类型及特殊性状等多方面因素，选取文昌鸡、藏鸡、茶花鸡、边鸡、静原鸡、北京油鸡、仙居鸡、狼山鸡、金湖乌凤鸡、汶上芦花鸡、东乡绿壳蛋鸡、河南斗鸡等26个代表性地方鸡种资源，融合公共数据库中原鸡序列信息；基于资源保护与品种鉴定重点应用方向，优选在染色体上分布均匀的位点23K。
同时，以国家地方鸡种基因库（江苏）有多世代完整系谱记录的保种群和高近交试验群为参照，通过多轮检出测试和相关性分析，建立了基因组水平的统计量度量和品种层次分析标准化技术，显著提升近交系数、亲缘系数、品种特征值等指标计算的准确性；在统一标准下科学评价保种效果，优化保种群结构，逐级判别品种个体血源比例。
该芯片适合国家级、省级鸡遗传资源保种场、基因库以及相关地方鸡遗传资源保护与品种鉴定的科研和企业推广应用。
该芯片的应用范围还包括系谱校正、群体遗传学分析、基因组关联分析等，使用操作简单、便捷。
该芯片的研发是在全国畜牧总站畜禽资源处、江苏省畜牧总站指导下完成，受国家重点研发计划重点专项（2021YFD1200302、2021YFD1200803）、江苏省种业振兴“揭榜挂帅”（JBGS[2021]029）、江苏省重点研发计划（现代农业）（BE2019353）、农业农村部和江苏省农业农村厅畜禽种质资源保护等项目资助。
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江苏省家禽科学研究所
资源保护与评价学科团队
江苏省家禽科学研究所（中国农业科学院家禽研究所）是省部共建的专业科研机构，是以家禽种质资源保护与评价、家禽遗传育种与种禽扩繁、家禽品种性能测定与品质监督检验、家禽重大疫病研究与防治等为主要任务的公益性科研单位。
该所资源保护与评价学科团队主要研究方向为鸡种资源保护、评价与利用，重点研究内容包括资源调查与引种技术规范研究、保种方法评价与优化研究、血缘更新理论与实践研究、品种遗传进化与种质基因挖掘研究等。
团队现有技术人员10人，其中研究员2人、副研究员1人，博（硕）士研究生5人；第三次全国畜禽遗传资源普查鸡普查专业组专家1人，江苏省“六大人才高峰”和“333工程”高层次培养对象1人。
拥有国家地方鸡种基因库（江苏）、农业农村部畜禽资源（家禽）评价利用重点实验室等平台，活体保存珍稀、濒危、特色地方鸡种32个，是目前国内最大、世界上活体保存鸡种资源最多的基因库。建成鸡DNA资源库，保存遗传物质3万余份。
近年来，承担国家自然科学基金、国家重点研发计划（子课题）、农业农村部物种资源保护、江苏省种业振兴“揭榜挂帅”、江苏省重点研发计划（现代农业）、江苏省自然科学基金等项目20多项，授权发明、软著专利19项，制定国家、地方标准6个，在《畜牧兽医学报》、《Communications Biology》、《BMC Genomics》等期刊发表研究论文60多篇，出版专著5部，参与6个国家级新品种（配套系）培育。获得部省、市各级奖项5个。在鸡遗传资源保护、评价与利用方向形成了鲜明特色和独特优势。
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| 文章作者：吴荣富 中禽传媒 文章编辑：一米优讯 |
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