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农产品生活环境中，如土壤、水域中含有大量的、多种微生物，但其中致病微生物较少，导致人类致病的病原菌主要有大肠杆菌（Escherich.coli）、李斯特氏菌( Listeria)、沙门氏菌( Salmonella)、耶尔森氏菌(Yersinia)等；导致农产品腐烂变质的微生物主要是真菌、细菌，其中真菌主要有灰霉（Bortytis sp.）、青霉( Penicillium sp.)、曲霉(Monilinia sp.)、交链孢(Alternaria sp.)等；细菌主要有欧文氏菌、假单胞菌、黄单胞菌等。另外，在各类肉食品、畜禽产品和水产品中还会有各种寄生虫的动物源性疾病病毒存在。
致病微生物在农产品中是普遍存在的。原因在于，工业化生产的预包装食品，可以通过生产工艺控制、以及消毒、杀菌工艺，清除病原微生物的污染。与之不同的是，农产品生长在不可控的土壤、水域等环境中，在采摘（收获）、包装、运输、贮存和销售等环节还频繁接触人群、空气、水等外界环境因素，因此，很难不受致病微生物的污染。作为消费者，应该树立积极的防范意识。在购买、保存到烹饪过程中避免致病微生物的污染。
小贴士：
如何在购买、贮存和烹饪食用农产品的过程中，尽量避免食物和人受到病原微生物的感染？
第一，一般情况下，病原微生物会通过食入、吸入、黏膜、皮下或者伤口感染等途径感染。广大消费者在购买，食用贮藏各类农产品的过程中都有可能接触病原微生物，多数人群对微生物有抵抗力，但体弱、多病、幼儿、孕妇等应注意尽量避免接触。
第二，在生吃各类食物时，如水果、蔬菜，应注意清洗干净。大多数感染致病微生物导致食物中毒的情况是由于清洗不充分导致的。
第三，对于肉、蛋、奶、水产品等应尽量避免生食，在清洗干净后，经过烹饪熟透之后食用。
第四，注意生熟食品分类保存。尽量不要将不同农产品混合保存。蔬菜、水果、海鲜、肉类和蛋奶等应当分开保存，以免造成病原体的相互污染。
第五，一旦发现贮存的农产品有异味或者腐坏的情况发生应该马上移出，并察看是否有污染到其他的保存的农产品。
第六，在购买过程中，应该注意从正规的、卫生状况良好的销售渠道购买农畜产品。
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