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畜禽防疫是畜牧业发展的基础和生命线，防疫密度的高低是衡量防疫质量的重要指标之一。当前，在一些地区因种种原因致使某些畜禽疫病流行，给畜牧业生产带来严重损失，农民的养殖积极性受到严重挫折，甚至整个地区农民增收受阻，这些问题已成为当前社会关注的热点问题。
当前基层防疫工作难点多
农民的侥幸心理阻碍了防疫工作的开展。一部分农民对防疫灭病缺乏科学认识，认为养畜禽防疫不防疫一个样。还有的见别人养的畜禽没防疫也未发生疫病，则认为自家的畜禽搞防疫吃了亏，下一年再养畜禽便不再愿意搞防疫接种了。也有的农民是因为不愿意掏防疫费，他们认为如侥幸不发病那钱不是白花了，但这些农民一旦遇到疫病流行，所养畜禽发病死亡时则往往后悔莫及。
养殖户自充兽医给自家养的畜禽搞防疫。
相当多的规模养殖户甚至个体养殖场，他们怕花防疫费，又因目前市场上到处都可以买到畜禽疫苗，他们通常的做法是到兽药门市或个体兽医手里买回疫苗，凭着对疫苗和防疫一知半解的认识，自充兽医给自家养殖的畜禽搞防疫，他们往往不懂得防疫操作规程和注意事项，也不懂得科学的免疫程序，更不知道买回的疫苗是否质量可靠，他们的出发点只是为了省钱。因此，这样的防疫如何能保证质量和效果，又如何能不出乱子呢?
宰卖病死畜禽现象较为常见。
无论是一般农户还是个体养殖场，对于病畜禽或死畜禽往往不愿意做无害化处理或埋掉，而是低价卖给个体屠宰或加工户，尤其是发病后期的育肥猪或成批病死的家禽；而个体屠宰加工户则将低价收购来的病死畜禽加工成卤肉、烧鸡、烤鸭等，大发昧心财。这种现象在许多地方常年查禁不绝，其后果造成该地区环境被病原体深度污染，往往造成疫病的流行或在一个地区此起彼伏，多年控制不了，还为疫病的传播插上翅膀，在很短时间内即可造成大面积流行。
盲目引种将异地畜禽疫病引进来。畜禽异地引种时，许多单位或个体农民往往不懂得检疫的重要性，有的在外地引进畜禽时根本未搞检疫，只是花点钱买张动物运输检疫证就将畜禽买回家来，也不懂得隔离观察饲养，直接入群人舍饲养，常常容易将许多本地原来没有的动物疫病引了进来。如近年来的奶牛热中，许多农民将别人的淘汰牛、病牛买了回来。从近年来一些地区的奶牛“两病”检测(布氏杆菌和结核病)结果看，有的阳性率高达20％真是令人触目惊心。
“以病养医”现象又死灰复燃。
很多地区在县乡机构改革中，将乡镇兽医站撤消或撤并，有的将农业各服务机构合并成立“农业综合服务中心”，其中一般只保留1名兽医，造成这些乡镇动物防疫没人搞，产地检疫没人检，兽医报表报不出。与此同时，大批基层兽医站人员被迫下岗，由“正规军”变成了社会游医。这批人员要养家糊口，他们最简单的做法就是不打防疫针，让动物发病然后治病挣钱，靠以病养医过日子。这是当前一些经济欠发达地区畜禽防疫工作最大的难点。
许多农民不懂得防疫灭病的基本知识。
农民缺乏科学的饲养管理和防疫灭病的常识，不懂得免疫程序，不知道畜禽在什么日龄应该防什么病，用什么疫苗，用多少疫苗，用什么接种途径；许多养殖户不懂如何给环境(如圈舍、舍外环境)消毒，有的农民只是在动物发病时或发生死亡后才知道给圈舍消毒；还有的农民从不法个体商贩手中买回假耳标给动物挂上，认为这样在自家卖猪时就合法了，殊不知这样的猪照样发病，真是自欺欺人。乱用药、滥用药的现象也很普遍，这不仅花了钱，而且起不到预防效果。
防疫难点原因分析
原有的防疫体系线断网破。新防疫体系尚未建立或健全。自2001年开始。很多地区在县乡机构改革中，把乡镇畜牧兽医站撤消和撤并，使原来健全运转几十年的市县乡村四级畜禽防疫体系毁于一旦，原有正常运转的防检疫工作已陷入瘫痪状态。
规模饲养场自己搞防疫。
在一些地区，规模化养殖近年来发展迅速，如养百头至干头的个体猪场，养千只至万只以上的个体禽场，有的地方规模养殖皇已占该地区总量的三分之一以上。这些规模饲养户和饲养场几乎100％都自家搞防疫，他们拒绝当地兽医部门的防疫计划和措施，导致一个地区新病传人和些规模养殖场
疫苗满天飞，防疫失控。
目前畜禽疫苗在市场上很容易买到，几乎所有兽药门市都在隐蔽地销售疫苗，许多药厂的业务员将疫苗送到这些兽药门市，甚至送到规模养殖户或养殖场手里，致使当地兽医部门常年防疫计划无法落实，防疫任务无法完成，当地疫病无法控制。
生猪为主的定点屠宰在一些地区名存实亡。
在一些地区，由于地方政府重视不够，缺乏长期有效管理制度，定点屠宰点已纷纷倒闭，多数小刀手依然在家中或黑窝点上杀猪，私屠滥宰长期得不到控制，造成国家大量税费流失，病害肉品使消费者的身体健康受到威胁，导致疫源扩散传播，使本地区的疫情长时间得不到控制，疫病此起彼伏、延绵不绝，给当地畜禽防疫工作增加难度等严重后果。
基层对异地引进的新病缺乏认识和防治方法。
近年来由于盲目引种而又忽视检疫，将国外的或外地的动物疫病引了进来，基层兽医同志大多对那些当地出现的新病缺乏认识，防治方法上拿不出有效措施，致使在一些地区新增疫病的发生率呈上升扩散趋势，而目前对那些病尚无定型有效的疫苗，基层兽医对此感到束手无策。
政企不分，指挥系统中气不足。
当前，市县两级防疫主管部门作为防疫灭病工作的指挥系统，其内部自上个世纪90年代以来，创收风盛行，许多事业单位把主要精力放在创收上，市县级主管局兽医站办起形式多样的公司、原料厂、兽药厂等，单位的分管局长或一把手、站长往往兼公司的董事长或总经理，把一些精干力量抽到公司任厂长、经理、科长等，这些人长期拿两份工资、奖金、福利，这种做法的结果不仅造成这些单位长期中心业务工作(如防疫工作)没人抓，对上应付，对下糊弄，更重要的是造成本单位内部人心涣散、人浮于事、勾心斗角，还导致这些地区动物重大疫病长期得不到控制，防疫事故时有发生，不仅导致一个地区防疫工作上不去，而且还容易滋生腐败和经济犯罪案件发生。
建议对策
重建重组适应新形势下的动物防疫队伍。针对目前一些地区基层兽医站解体、防御体系破裂，一盘散沙的局面，市县畜牧兽医主管部门应积极敦促政府及同级人事部门，重组重建辖区内的动物防疫队伍。不改革不能促进发展，但改革必须适应新形势下的 客观需要。重组的防疫队伍人员应精干(但要适应辖区内畜禽养殖的防疫工作量)、高素质、高觉悟(能吃苦耐劳、热心为农民服务)，这支队伍应由县兽医主管部门垂直管理，作为县兽医站的派出人员到乡镇实施动物常年防疫任务(季节性大批量面上防疫时还应由乡镇政府组织协助)，他们应是县业务主管部门与同级人事部门联合在社会上经考核后招聘的，他们在聘期内的工资待遇应享受财政拨款，使他们工作起来能轻装上阵无后顾之忧。
各级政府都应把畜禽防疫工作放到重要议事日程，加大投入，负起责任。国家动物防疫法第七条明文规定：“各级人民政府应当加强对动物防疫工作的领导。”加大对动物防疫灭病工作的投入(如畜禽防疫工作所需的疫苗费、消毒费等)，担负起动物防疫工作的领导责任。
把住源头管理。
目前社会上兽药、疫苗满天飞，供销渠道更是多种多样，业务员、药贩子、兽药门市部都在以各种形式推销兽药、疫苗，真是良莠不齐、真假难辨，到头来吃亏的仍是农民，遭受损失的是畜牧业和国家经济发展。在这个问题上，必须把住源头管理。各省市必须抛开地方保护主义，下决心把未经国家农业部认可的生物制品厂家坚决取缔，规范兽用生物制品及兽药的供货渠道，实行专营和主渠道供应，非此，无法纠正目前生物制品及兽药市场的混乱局面。
完善法律法规，坚决取缔小刀手和私屠滥宰。
目前已颁布的有关法律法规都没有对政府不重视定点屠宰的追究责任条款，也没有对小刀手私屠滥宰的刑事追究处罚条款。因此，急需对有关法律法规进行修改补充。无论从防疫灭病、卫生、环保、人民健康等哪个方面都不允许小刀手私屠滥宰的现象存在，必须坚决取缔。工商、税务、卫生等有关部门都应摒弃部门利益，通力配合政府做好定点屠宰和取缔小刀手私屠滥宰这项具有战略意义的工作。
加大科普推广和科技普及的力度。
目前虽然农民缺医少药的局面已有很大改观，但农民缺少科技、缺乏科学饲养和科学防疫灭病知识的情况仍十分严重。许多农民盼望发家致富，希望通过发展养殖业来实现增收，但他们缺少科技知识，缺少良种良法。因此，尽快健全农村中基层科技推广体系，通过他们作为桥梁和纽带，手把手地教会新一代农民掌握科学养殖和防疫灭病的技术，从基础上为早日在每一个地区控制和消灭动物重大疫病和人畜共患疾病作出贡献，整个畜牧业发展的进程将会大大加快。
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