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在饲养密度高的鸭舍里，空气传染病的机会增多，特别含氨量高时，常会诱发呼吸道疾病。肉鸭生产的后期管理应该以通风换气为重点。由于肉鸭后期体重增大、采食量大、排泄量也增大，肉鸭呼出的二氧化碳、散出的体热、排泄出的水分、舍内累积的鸭粪产生的氨气以及舍内空气中浮游的尘埃等，如果不能及时排到舍外，舍内的生存环境就会越来越恶劣，这样不但会严重影响肉鸭的生长速度，而且还会增加肉鸭的死亡率。
养出来的”气囊炎“，捂出来的“肺炎”
盲目保温不敢通风，造成鸭舍长期缺氧导致肺脏功能衰竭从而引起伤亡率增加。温度高，还容易引起肺热，难以治疗，尤其是养殖后期，出现这种情况的几率很大，而温度这个问题应是一个慢慢下降的过程，有的养殖户，前期不注重通风和降温，怕把鸭冻着，怕鸭感冒，等到25天左右的时候问题就随之而来了，捂出病来了，就猛通风，越通死亡率越高，与此同时呼吸道病情加重，他就又不敢通风了，又本能地捂起来了，经过这番折腾谁家的鸭能受得了呢？这时候养殖户还说，这鸭越来越难养了，养得都不会养了。
心包积液：
主要跟饲养环境有关，鸭舍通风不良，密度过大，有害气体较多，氧气量较少，导致肉鸭机体缺氧。肉鸭为了获得较多的氧气，呼吸加快，时间长了，肺部淤血，其中血管狭窄，由心向肺的血流受阻，右心作为血流的动力因负担加重而代谢性增大，继而疲劳松弛，不能正常接受来自肝脏的静脉血，使肝脏淤血，由肠管流向肝脏的静脉血流有受阻，整个肠管淤血。
由于机体需要氧气不足，心脏负担加重。血浆就会从心脏中渗出， 继而发生心包积液，而且这种鸭有一个特点，心脏变形似桃心形。真正的是三角的，有弹性。凡是通风不良引起的死鸭，一般都有一个特点，夜间死鸭多，尤其后半夜。因为后半夜容易缺氧，外面气压低。
通风的原则：凉风不能直接吹到鸭身上。鸭棚内各区域没死角，通风通透均匀。
通风的前提：在保证温度和湿度正常的前提下通风（核心在于运用合理的方式在通风的同时保证温度和湿度）。
通风的方式：根据不同的鸭舍采取不同的方式。
通风的目的：确保鸭舍内氧气的供应，降低有害气体的含量。 鸭舍内氨气的含量不能超过20ppm，氧气量不能低于18%.
存在的问题：
一、为了省煤而封闭鸭舍，造成通风不好，氧气含量下降，有害气体含量升高，机体吸氧量降低，体内氧化过程缩短，抵抗力下降，使机体处于亚健康状态，诱发疾病。
二、 有害气体的刺激，加重了呼吸道疾病的症状，大量投药效果不明显。
三、怕通风使鸭群感冒了，而减少通风量。 通风方式不合理，使鸭舍内温度聚降，凉风直接吹到鸭身上，鸭群感冒，继发其他的疾病。
四、晚上为保温而封闭鸭舍，加重了病情，降低了用药的效果，增加了养殖成本。
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