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本病可影响两周龄到四月龄的青年猪，尤其是5-8周的仔猪最易感染和发病;母猪及种公猪亦可感染，但多以隐性感染为主，表现为慢性跛行。
副猪嗜血杆菌只感染猪，可以影响从2周龄到4月龄的青年猪，多在断奶前后和保育阶段发生，常见于5～8周龄的猪，发病率一般在10%～15%，严重时死亡率可达50%。
急性病例往往发生于膘情良好的猪，病猪发热(40.5～42.0℃)，精神沉郁，食欲下降，呼吸困难，腹式呼吸，皮肤发红或苍白，耳部边缘发紫，下眼睑水肿，行走缓慢或不愿站立，腕关节、跗关节肿大，临死前侧卧或四肢呈划水样，有时无明显症状而突然死亡。
慢性病例多见于保育猪，主要是食欲下降，咳嗽、呼吸困难，被毛粗乱，四肢无力或跛行，生长不良，直至衰竭而死亡。猪群若存在其他呼吸道病，如支原体肺炎、猪蓝耳病、圆环病毒病、猪流感、伪狂犬病和猪呼吸道冠状病毒感染时，副猪嗜血杆菌病的危害会加大，会加剧生产中保育猪的PMWS(断奶仔猪多系统衰竭综合征)的临床表现。
小猪和中大猪。病初期病猪高烧，且持续不退(从发病一直到死亡，病猪持续性高烧)，体温40.5-42℃(严重的可达43℃)，体表皮肤发红，严重者呈酱红色，个别甚至皮肤坏死脱落。病猪精神萎顿，食欲、饮欲废绝，畏寒，拥挤而卧，昏睡不醒。呼吸急促，呈腹式呼吸。发病后期，病猪进行性消瘦，皮肤逐渐苍白，后发青变紫。关节肿大，被毛粗乱(形如刺猬)，耳朵发绀，全身淋巴结，特别是腹股沟淋巴结严重肿大。
解剖这类病猪，几乎都有心包积水和纤维素性渗出性肺炎的特征性病理变化。严重者肺脏和胸腔粘连，心肌与心包粘连呈绒毛心。心源性水肿，在离心脏较远，血液循环较慢的后肢关节腔及关节腔附近皮下，多见浅黄色胶冻样渗出。
容易继发沙门氏菌病。目前虽无法准确说明副嗜血杆菌病与沙门氏杆菌病的内在联系，但发生副嗜血杆菌病的病猪，的确很容易继发沙门氏杆菌病，表现出又腹泻又喘气的症状。用抗生素控制住猪副嗜血杆菌后，一旦停止抗生素治疗，60%以上的康复猪继发沙门氏杆菌病。若不及时用药，病猪将逐渐消瘦，拉糠麸状带渣的黄色(后期变为暗红色甚至黑色)粪便，皮肤苍白，衰竭死亡。这类病猪大都可见腹股沟皮下密集的紫色出血斑点，有的腹股沟皮下浅表静脉扩张突出，颜色变蓝或发紫。
解剖几乎都可以见到典型的沙门氏杆菌病症状，从结肠到直肠，肠内膜遍布圆形、乳白色、火山样突出的溃疡结节，越往后段越密集。切开病灶，有脓性分泌物排出。
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