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目前，对鸭瘟尚无有效药物可治疗，而对鸭霍乱药物治疗效果很好。此两种病大症状很相似，很易混淆，所以在防治时务必准确鉴别，才能确保治疗效果，减少不应有的损失。
一、流行病学特点鉴别1、鸭瘟仅引起鸭、鹅自然发病，流行期比较长，当鸭瘟传入一个易感鸭群时，一般在3~7天后开始出现零星病鸭，再过3~5天后才开始大批发病，整个流行过程可达15~30天，死亡率平均在90%以上。而鸭霍乱在各种家禽包括鸭，鸡，鹅、火鸡和鸽均可感染。病程短促，病程一般在数小时至2天内死亡。雏鸭常呈流行性发病，死亡率可达80%以上。成鸭多为散发性流行，其流行呈间歇性。2、鸭霍乱一般是零星发生，突然死亡，尤其是正在产蛋的母肉鸭颇为多见。鸭霍乱能传染给鸡、甚至猪；而鸭瘟流行范围较广，病程也较长，一般多在病后4~6天死亡，但不传染给鸡、猪。
二、临床症状鉴别1、鸭瘟特征性症状是流泪、眼睑肿胀，两脚发软不能站立，下痢、头颈部肿大，俗称“大头瘟”。而鸭霍乱最急性病例可无任何症状而突然死亡。急性病例呈现精神萎顿，食欲停止，呼吸困难，口腔和鼻孔有时流出带泡沫粘液，有时流出血水，频频摇头，很快死亡，俗称“摇头瘟”。2、翻开鸭肛门，出现充血，水肿或有黄绿色假膜者，则可判断是鸭瘟。
三、剖检鉴别1、鸭瘟病例食道和泄殖腔粘膜有黄褐色假膜覆盖，腺胃粘膜出血或坏死；而鸭霍乱在胸膜腔的浆膜，尤其是心冠沟和心外膜有大量出血点，脾脏常呈樱桃红色。最具特征的是整个肝脏表面散布着灰白色针。2、发生鸭霍乱的病鸭或死鸭，肝脏表面有许多针头大小、分布均匀的灰白色的坏死；而鸭瘟则没有这些症状，但全身皮肤表面有许多出血斑点，头颈部出血更为严重。
四、死状鉴别患鸭霍乱的病鸭，死亡前常摇头；死亡时口、鼻流稀血水，嗉囊内充满饲料，手摸感觉硬实；而患鸭瘟的病鸭，流涕流泪，死亡时眼睛充血，嗉囊内虚无食物，手摸感到松软。
五、药物治疗鉴别鸭霍乱可用磺胺类药物或抗菌素治疗，效果满意，但对鸭瘟则无效。
散养鸡如何做好免疫
养鸡一般可参考商品代蛋鸡免疫程序进行免疫：
1 日龄肾传支（H94 或 W93） 滴鼻点眼，
8~9 日龄克隆 30＋传支 120＋肾传支三联苗滴鼻点眼，
14 日龄法氏囊活苗滴口，21日龄传支 H120＋克隆 30 或四系疫苗滴鼻点眼，
25 日龄新城疫油苗＋禽流感 H9 二联苗皮下注射，27 日龄法氏囊活苗 2 头份饮水，
31 日龄鸡痘疫苗刺种，
47 日龄传染性喉气管炎疫苗 1．5 头份饮水，60 日龄鸡痘疫苗刺种，
80 日龄传染性喉气管炎苗 1头份饮水，90 日龄传染性支气管炎苗 H52 饮水，95 日龄多价大肠杆菌苗 0．5～1 毫升皮下注射，
110 日龄新城疫＋减蛋＋传支三联苗或新城疫＋减蛋＋传支＋流感 H9 四联苗肌肉或皮下注射，
120 日龄禽流感苗多价苗（H9 ＋H5）肌肉或皮下 注 射 ，非流行地区使用 H9 疫苗。
250 日龄大三联油苗胸肌注射（0．8 毫升／羽）。
一些养殖户采用简化程序也能基本上控制疫情：
1 日龄马立克氏病疫苗皮下注射或肌肉注射，
3~9 日龄用新支二联苗滴眼和鼻，
10～14 日龄法氏囊疫苗饮水或滴口，
20 日龄新城疫 2 系滴眼鼻，
60～62 日龄新城疫Ⅰ系、 鸡痘活疫苗胸部肌肉注射，
120~125 日龄新支减疫苗皮下或肌肉注射。
具体免疫程序应根据鸡苗、当地疫情、 养殖条件等诸多情况而定，也可以向购买鸡苗的种鸡场咨询获得供免疫建议。
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