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蛋黄的颜色和脂溶性色素有关，但是鸡本身并不会合成这种色素，主要是来源于摄入的饲料中。因此，影响蛋黄颜色深浅的原因很多，下面简单的列举了几点主要的原因：
1．日粮叶黄素含量不足。一些饲料原料叶黄素含量较低(小麦、大麦、稻米或它们的副产品)，如果在蛋鸡日粮中它们的使用比率较高的话，蛋黄颜色将较差。
2．疾病导致的利用率降低。不管日粮着色剂供应情况如何，疾病如球虫病、隐孢子虫病、营养吸收障碍、IBD或其他病毒性疾病均会负面影响色素沉积。
3．饲料受毒枝菌素污染会降低蛋黄着色，因为毒素影响鸡的代谢和吸收途径。
4．饲料原料如玉米、玉米蛋白粉中的叶黄素发生氧化。大多数叶黄素容易氧化。随着储存时间增加，原料中的叶黄素含量逐步降低。在玉米蛋白粉(表面积较大)和去壳谷粒比例较高的谷物中尤为明显。
5．蛋黄发育时间不充分。蛋黄完全着色需要10天。因为色素沉积随卵巢中卵泡的发育而增强。卵泡发育(主要小囊产生)需要10天，因此完全沉积色素也需要这段时间。要获得满意的蛋黄色素沉积，一般建议在产蛋前饲喂含色素饲料两周，使颜色完全生成。
6．维生素AS乏。许多类胡萝卜素具有维生素A原的活性，它们可以在体内转化为维生素A。有效的蛋黄色素沉积必须考虑到维生素A的状态。如果维生素A过量饲喂，相互竞争吸取，将降低蛋黄的色素沉积程度。如果蛋鸡存在 生素A不足，类胡萝卜素就会转化为 三素A以满足蛋鸡的营养要求，从而降低色素沉积程度。正确的维生素A添加量 这两种影响平衡，推荐在蛋鸡饲料 生素A的含量最低不少于10,000IU／kg， 超过15，000IU／kg。这种效果也 蛋保持较高的色素，对消费者 的维生素A原的来源。
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