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农业部办公厅8月24日印发《2013年畜禽种质资源保护项目申请指南》（以下简称指南）引导国家级畜禽保种场、保护区和基因库以及具备相应技术条件和资质的单位申报保种项目，以对138个珍贵、稀有、濒危的畜禽品种实施重点保护，使受保护的畜禽品种（类型）不丢失、主要经济性状不降低，进一步提高畜禽资源保护与管理水平。
二十世纪八九十年代开始，外来畜禽品种被大量引入国内，由于这些品种已经过长期的选育和改良，其生产性能远优于我国地方特有畜禽品种，致使我国地方特有畜禽品种迅速减少，有的濒临灭绝。
比如，从欧美引进的大白、长白和杜洛克种猪凭借其杂交后代优良的生长速度和瘦肉率迅速挤占了东北民猪、太湖猪等地方猪种的生存空间，给我国畜禽遗传资源遭到严重破坏。
2006年农业部颁布《畜禽遗传资源保种场保护区和基因库管理办法》开始，农业部或地方每年都发布此类畜禽种质资源保护项目申请指南，鼓励各单位申报。对评审通过的的单位国家从财政给予资金支持，保证保种项目的开展。这说明政府开始重视对我国地方特有畜禽品种的保护工作。这对我国畜牧业和专业畜禽育种公司是长期利好消息。
目前，我国畜禽种质资源的保护主要通过建立起国家级或省级保种场、保护区和基因库而开展的。
保种场，是指有固定场所、相应技术人员、设施设备等基本条件，以活体保护为手段，以保护畜禽遗传资源为目的的单位。保护区，是指国家或地方为保护特定畜禽遗传资源，在其原产地中心产区划定的特定区域。基因库，是指在固定区域建立的，有相应人员、设施等基础条件，以低温生物学方法或活体保护为手段，保护多个畜禽遗传资源的单位。基因库保种范围包括活体、组织、胚胎、精液、卵、体细胞、基因物质等遗传材料。
本次《指南》重点支持列为国家级保种场、保护区和基因库的单位。支持保护的品种为《国家级畜禽遗传资源保护名录》（农业部公告662号）内138个畜禽品种，包括猪、鸡、鸭、牛、马、兔、鹅、羊、驴、鹿、獒、蜂、骆驼等品种。比较适合畜牧企业申报的项目是保种场项目，但该企业必须先取得国家级保种场资格。
要有效开展畜禽种质资源的保护，除了以项目申报的形式外，还应从以下四个方面加以推进：
1、加强宣传，增强保种意识。通过网络、电视、报纸、书刊等媒介大力宣传畜禽种质资源保护的重大意义，从思想意识上引起重视。
2、做好科学规划。充分考虑群体有效含量和地区分布，保种规模过大没有经济价值，过小世代近交系数上升快。
3、进一步优化畜禽种质资源保护体系。进一步健全的法律法规、健全保种机构、加强保种工作专业队伍的技术培训、建立专业系统化的畜禽种质检测技术体系等，从根本掌握我国畜禽资源的变化动态和应对措施。
4、积极开发和充分应用地方种质资源。这是最经济实惠的保种方法。地方品种有其独特之处，比如肉质好，繁殖性能高等，我们应该充分选育应用这些固有优点培育出新的品种，使保种与利用有机结合，持续健康发展。
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