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(一)品种质量不高，生产性能低下
目前我国内蒙古黄牛的改良率是47.36 %，但是良种牛仅仅为9.43%。再加上内蒙古的黄牛长期以来都是役用为主，饲养管理方式又比较粗放，长期营养不足，生长速度缓慢，虽然其出栏率较高，但是其产肉量却很低。相比世界水平的平均胴体为199kg，低了24.4kg，仅为174.6kg，与一些肉牛业发达的国家比较起来，如澳大利亚、加拿大分别低了68.4kg和137.4kg。虽然一直以来，自治区的牛肉产量一直持续增长，但是由于我国人口数众多，人均占有量还是极为低下的。因而，当前我们要解决的就是提高肉牛的品种质量，促进肉牛业的发展。
(二)饲养管理方式落后且过于分散
随着生活水平的提高，人们对高质量牛肉的需求也日益提高，而内蒙古这种传统的分散饲牛方式想要生产高档化的牛肉几乎是无法实现的，只能通过集约化的生产方式来生产出高品质的牛肉。长期以来，饲料营养价值低下，主要靠粗饲料为主，精饲料比例过低等原因造成了产肉质量无法得到保证。
(三)屠宰设备，加工工艺的技术水平低下
总的来说，我国市场流通的牛肉大多数仍属于个体屠宰，卫生环境质量差。由于在屠宰过程中放血不干净或是受到了惊吓，再加上屠宰环境一般都是常温，起不到冷却和排酸的作用，而严重地影响了牛肉的质量。造成一现象的主要原因是由于大型屠宰加工企业屠宰成本高，相比较之下个体屠宰户就来得经济实惠，结果必然导致个体屠宰占了很大的比例。
加工工艺仍使用的是热切割这种落后的方式，不仅导致屠宰后的牛肉受到严重污染，还大大地影响了冷藏期牛肉的质量;绝大数牛肉类企业还是停留在简单的初加工水平上，严重缺乏深加工的条件，致使企业的产品加工科技含量过低。同时，受过专业培训的专业人员很少，没有令人信服的素质，对整个牛肉业的发展造成了极大的阻碍。
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