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猪流行性腹泻（PED）是由猪流行性腹泻病毒（PEDV）引起的能使新生仔猪发生呕吐、严重水样腹泻的一种急性、高度传染性、高致死性的猪病。哺乳猪、架子猪或肥育猪的发病率很高，尤以哺乳猪最为严重。病猪是主要传染源。
病毒存在于肠绒毛上皮细胞和肠系膜淋巴结，随粪便排出后，随饲料、饮水、交通工具及用具等传染。如果一个猪场连续有仔猪出生或断奶，病毒会不断感染失去母源抗体的断奶仔猪，在这种繁殖场内，猪流行性腹泻可造成5- 8周龄仔猪的断奶期顽固性腹泻。PEDV属冠状病毒科，冠状病毒属，是单股正链RNA病毒。PEDV基因组（全长约28kb）具有7个开放阅读框（ORF）、编码4种结构基因以及3种非结构基因，其中S基因编码纤突蛋白，决定了PEDV的侵袭与增殖能力，根据蛋白结构的不同可划分为S1基因和S2基因。
PEDV于1971年首先在英国报道，随后6年在其他欧洲国家相继发现。自20世纪80年代以来，PEDV在亚洲广泛流行。2010年我国道大规模PED发病，其与一种新型PEDV（Pandemic株）相关，该毒株与PEDV的原型毒株CV777遗传关系较远。2013年4月，在北美地区首次发现并报道了PED。2014年，美国发现S1基因发生变异的新型PEDV毒株INDEL。进化分析表明PEDV可分为G1（原型毒株）和G2（流行毒株）两个亚群; G2亚群可进一步分为G2a和G2b两个亚型。
猪δ冠状病毒（PDCoV）
属冠状病毒科、δ-冠状病毒属，该病毒是一种新型猪肠道冠状病毒，可引起5-15日龄哺乳仔猪腹泻呕吐,迅速脱水,衰竭而亡,发病率和死亡率高达50%-100%，生长猪、成年猪及生产母猪发病轻微，可不治而愈。PDCoV于2012年首次在香港发现，随后我国大陆和美国陆续从临床病料中检出PDCoV。
★检测中心提醒：新生仔猪出现呕吐，水样腹泻，脱水等症状时不要轻易诊断为传染性腹泻或传染性胃肠炎，还有可能是PDCoV的感染。
本报告收集了2015-2016年华中地区（山西、河南、湖北）70例出现严重水样腹泻的仔猪粪便及肠道组织样品进行PCR检测分析，检出PEDV阳性病料59份，检出率为84.2%；检出PDCoV与PEDV均为阳性的病料2份，检出率为2.9%。
对PEDV的S基因进行相关的进化分析，取自病料的10株PEDV中，7株来源于G2a亚群，3种来源于G2b亚群，见图1。
图1 PEDV S基因核酸序列的进化树
分析，“●”表示从本报告中的10个分离株通过分析三株来源G2b亚群的毒株的S2基因后发现，与其他G2b亚群参照基因相比缺失3nt片段。在vero细胞上培养后，仅成功分离到CH hubei 2016毒株。全基因组测序分析表明CH hubei 2016毒株更接近美国INDEL毒株和G2a亚群，其可能是由AH2012-12毒株（G2b亚群）和CH-ZMDZY-11毒株（G2a亚群）进化而来的，见图2。G2亚群的毒株是引发华中地区PED流行的主要病毒，此外，在S基因中发现的部分基因片段的缺失和重组，表明华中地区的PEDV发生了适应性变异。
图2 PEDV 全基因核酸序列的进化树
分析，“●”表示从本报告中的1个分离株本文翻译自：Li D, Feng H, Liu Y, et al. Molecular evolution of porcine epidemic diarrhea virus and porcine deltacoronavirus strains in Central China[J]. Research in Veterinary Science, 2018
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