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2023年4月份猪病检测信息汇总


现代畜牧网 http://www.cvonet.com 2023/5/26 8:56:28 关注:955 评论: 我要投稿

  摘  要
  2023年4月份,信得科技检测中心为全国112家猪场提供了检测服务,其中病原学样品700份,血清学样品732份,整体检测量呈上升趋势,主要送检省份仍以山东省为主,河南省送检量有明显提升;4月份PRRSV仍有较高的检出率,PCV3、PEDV和PoRV检出率明显提升。测序结果分析显示PRRSV以NADC30-LIKE基因型为主;PEDV以S-INDEL-LIKE基因型为主;PoRV G5、G9和G3 均有检出。
  表1. 中英文缩写

  一、 整体检出情况
  1. 各省份送检情况
  2023年4月份,各地区送检情况统计如下(表2):
  表2. 各省送检量及占比

  2. 病原检测数量统计
  2023年4月份检测反应总数为1269个,其中阳性反应数量为427个,占比33.7%。病毒检测总数最多的为PRRSV,检出率35.5%;细菌检测总数最多的为HPS和SS,检出率最多的为APP和大肠杆菌;支原体检测总数为45,检出率为84.4%(表3)。
  表3. 病原检出数量统计

  3. 常见病毒检出统计
  2023年4月份病毒检出以PRRSV为主,检出率为25.3%,PPV和JEV送检量较少,结果如下(表4)。
  表4. 病毒检出统计

  4. 常见细菌和支原体检出统计
  2023年4月份细菌检出占比最高的为APP,检出占比为6.3%,HPS和SS检出占比有所下降;支原体检出占比为59.4%(表5)。
  表5. 细菌和支原体检出统计

  5.2022年与2023年4月份检出率对比
  PRRSV同比增长2.7%;PCV2同比增长6.8%;PCV3同比下降11.6%;PEDV同比下降1.0%;PoRV同比增长3.9%;HPS同比下降22.6%;SS同比下降13.5%;巴氏杆菌同比下降18.2%;支原体同比增长23.0%(表6)。
  表6. 2022年与2023年4月份检出率对比

  二、重点病原检测情况
  1. 蓝耳病病毒(PRRSV)
  1.1. GP5 基因分析
  2023年4月份,检测中心对检测出的PRRSV 进行测序,按照 GP5 编码基因进行基因分型,共测序分型成功26株毒株。其中5株(19.2%)谱系8分支;谱系1有20株(76.9%),其中2株(10.0%)属于NADC34-LIKE分支,18株(90.0%)属于NADC30-LIKE分支;1株(3.9%)属于谱系5分支(图1)。
  在谱系8分支中,测序毒株与市售疫苗株核苷酸一致性为91.4%~99.3%;在谱系1分支中,测序毒株与市售疫苗株核苷酸一致性为82.2%~86.8%;在谱系5分支中,测序毒株与市售疫苗株核苷酸一致性为99.1%~99.6%。


  图1. 2023年4月份PPRSV GP5基因进化树

  1.2 NSP2 基因分析
  2023年4月份,检测中心对检测出的PRRSV NSP2 基因进行测序,按照 NSP2 编码基因进行基因分型,共测序分型成功11株独立毒株,其中5株(45.5%)属于谱系8分支,6株(54.5%)均属于NADC30-LIKE分支(图2)。


  图2. 2023年4月份PPRSV NSP2基因进化树

  2. 流行性腹泻病毒(PEDV)
  2023年4月份,检测中心完成4株PEDV Spike蛋白基因(S)测序,根据S1基因进行基因分型,检测出1株G2b基因型毒株(25.0%),3株S-INDEL-LIKE基因型毒株(75.0%)(图3)。
  在G2b分支中,测序株与市售疫苗株的核苷酸一致性在97.4%~97.7%;在S-INDEL-LIKE分支中,测序株与市售疫苗株的核苷酸一致性在92.6%~94.0%。


  图3. 2023年4月份PEDV S1基因进化树

  3.轮状病毒 (PoRV)
  2023年4月份,完成5株PoRV VP7(G基因型)基因测序,2株(40.0%)为G5基因型,2株(40.0%)为G9基因型,1株(20.0%)为G3基因型(图4)。
  在G5分支中,测序株与疫苗株的核苷酸一致性为72.6%~77.4%;在G9分支中,测序株均与疫苗株的核苷酸一致性为83.0%~86.6%;在G3分支中,测序株与疫苗株的核苷酸一致性为67.4%~68.8%。


  图4. 2023年4月份PoRV VP7基因进化树

  4. 猪圆环病毒
  2023年4月份,根据PCV2 Cap蛋白编码基因进行分型,完成3株PCV2测序,分别属于PCV2a、PCV2b和PCV2d分支。在PCV2a分支中,测序毒株与LG信得疫苗株的核苷酸一致性为95.8%;在PCV2b分支中,测序毒株与DBN-SX07-2信得疫苗株的核苷酸一致性为99.5%;在PCV2d分支中,测序毒株与信得疫苗株的核苷酸一致性为95.3%~97.0%。
  2023年4月份,根据PCV3 Cap蛋白编码基因进行分型,完成2株PCV3测序,均属于PCV3a分支;与参考株核苷酸一致性为96.7%~99.2%。

文章来源:信得科技     文章编辑:一米优讯     
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