中国农科院牧医所牛遗传育种科技创新团队发表BIOL DIRECT(IF=4.9)||研发整合多组学信息基因组预测新方法
现代畜牧网 http://www.cvonet.com 2025/7/11 8:18:12 关注:55 评论: 我要投稿
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近日,中国农业科学北京畜牧兽医研究所牛遗传育种科技创新团队通过整合多组学信息,筛选功能变异,显著提升重要经济性状的预测准确性,为揭示复杂性状遗传基础和优化基因组选择策略提供了新思路。研究成果发表在《Biology Direct》期刊上。
国内外研究表明利用转录组、表观组等多组学信息可有效鉴定与表型相关的功能调控位点,同时,通过整合基因表达、表观修饰等信息到预测模型,可显著提高预测准确性。研究团队基于华西牛的43个经济性状表型和填充测序变异,通过构建覆盖基因组、转录组、代谢组和表观组等层次的11个功能SNPs分组,研发整合组学基因组预测方法。研究发现本方法与WGS数据相比,高评分的前10%SNP组的预测准确率大幅提高。利用BayesB模型基于WGS数据的高评分前10%SNP组的预测准确率平均提高了11.6%,利用GBLUP方法平均提高了7.54%,在日增重和宰前活重中,BayesB预测准确率分别提高6.70%和5.73%。本研究为整合组学信息优化变异筛选、提高基因组预测准确性,研发改进基因组选择策略提供新思路。
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所研究生赵志达和牛群皓为第一作者,朱波副研究员、徐凌洋研究员和李俊雅研究员为共同通讯作者。该研究得到了国家重点研发计划和国家自然基金等项目的资助。
文章链接:DOI: 10.1186/s13062-024-00574-y原文标题:中国农科院牧医所牛遗传育种科技创新团队发表BIOL DIRECT(IF=4.5)||研发整合多组学信息基因组预测新方法来源:国家畜牧科技创新联盟
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文章来源:国家畜牧科技创新联盟 文章编辑:一米优讯 |
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