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L种新型轮状病毒原型
毒株的全基因组测序分析
Reimar Johne，Katja Schilling-Loeffler，Rainer G Ulrich，Simon H TauschPMID: 35336869
DOI: 10.3390/v14030462
轮状病毒可感染人类和动物，是引起腹泻的主要病原。轮状病毒无囊膜，其基因组由11个双链RNA片段组成。基于对VP6衣壳蛋白的基因组和氨基酸序列分析，目前将轮状病毒划分为A~J（RVA~RVJ）种。此外，最近从普通鼩鼱（Sorex araneus）上检出新型轮状病毒，根据部分基因序列，推断其为新型轮状病毒K（RVK）和L（RVL）种。本文介绍了RVL原型毒株KS14/0241的全基因组序列。该毒株VP6基因推导氨基酸序列与RVA~RVJ参考株同源性仅为47%。系统发育分析显示，RVL的11个基因片段均独立于之前对轮状病毒的划分，单独形成一个聚类（clustering），在RVB样进化分支上与RVH和RVJ的关系最为密切。RVL的非编码基因组片段末端在5'端（正义RNA链）可见保守序列，这是所有轮状病毒的共同特征，而RVB样进化分支在3'端可见保守序列。结果表明，该病毒可归类为新型轮状病毒L种（RVL）。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35336869/
牛病毒性腹泻病毒感染后
干扰素（IFN）应答情况研究进展
Quanjiang Song，Xinyi Zhao，Changchang Cao，Mingmei Duan，Chunyan Shao，Sheng Jiang，Bin Zhou，Yingshan Zhou，Wanyu Dong，Yang Yang，Xiaodu Wang，Houhui SongPMID: 35839708
DOI: 10.1016/j.rvsc.2022.04.011
牛病毒性腹泻病毒（BVDV）是造成牛场重大经济损失的重要病原体。怀孕母牛感染BVDV后，表现胎儿感染和生殖障碍，甚至出现早期胚胎死亡、流产和死产。应注意的是，免疫小母牛不能为牛胎儿提供BVDV抗体保护。BVDV可分为两种基因型（BVDV-1和BVDV-2）和两种生物型（细胞病变型（CP）和非细胞病变型（NCP））。母牛在妊娠期感染NCP-BVDV，会导致牛胎儿持续感染（PI），并终生携带病毒，成为其他牛的主要感染源。BVDV可诱导免疫抑制并加重牛呼吸道疾病（BRD）。因此，BVDV感染会引起各种不同的临床症状和免疫反应。干扰素（IFN）可通过激酶抑制剂（Janus Kinase，JAK）-信号转导和转录激活因子（STAT）途径介导抗病毒感染的先天性免疫应答。据报道，BVDV感染可对IFN应答产生不同程度的影响。有趣的是，有报道表明，IFN可显著抑制多种病毒。人α-IFN可用于抑制体内的BVDV。在本文中，我们总结了BVDV感染过程中IFN应答的最新研究进展。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35839708/
逆转录重组酶聚合酶扩增结合横向试纸法
（RT-RPA LFD）快速、直观检测BVDV和BPIV3
Sen Yang，Qian-Ying Wang，Bin Tan，Peng-Fei Shi，Lian-Jiang Qiao，Zhi-Jie Li，Ke-Xin Liu，Zhi-Gang Cao，Shu-Qin Zhang，Fei-Yan SunPMID: 34728269
DOI: 10.1016/j.jviromet.2021.114343
牛呼吸道综合征（BRDC）是一种严重影响我国和世界各地圈养牛的疾病。牛病毒性腹泻病毒（BVDV）和牛副流感病毒3型（BPIV3）是引发BRDC的主要病原，也是影响养牛业的主要毒株。为根除上述病毒/疾病，需要快速鉴定病毒，并进行治疗。因此，本研究采用逆转录重组酶聚合酶扩增（RT-RPA）和横向试纸（LFD）法，分别基于BVDV 5′-UTR基因和BPIV3磷酸化蛋白P基因，设计了引物和横向（LF）探针，建立了1种可快速、简便鉴定BVDV和BPIV3的方法。在35 °C试验环境中，使用RT-RPA在25 min内成功扩增BVDV和BPIV3 RNA，横向试纸在室温（RT）中5 min内可观察检测结果。BVDV的最低检出限为50拷贝RNA，BPIV3的最低检出限为34拷贝RNA。研究证明，本试验建立的双向RT-RPA LFD方法精确、定向，可作为BVDV和BPIV3现场分子学诊断工具。该方法可检测瘟病毒A、B属和BPIV3，且与猪瘟病毒（CSFV）和牛传染性鼻气管炎病毒（IBRV）等无交叉反应。临床样品检测进一步对该方法的检测性能进行评估，发现其与实时RT-PCR（RT-qPCR）相比，表现出良好的性能。此外，RT-RPA LFD方法更快速，且操作简便，无须过多培训。
原文链接：
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/34728269/
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